CF202121580
Evaluation biologique de ligands et de protéines interagissant avec l'ADN en i-motifs
J-44
Doctorat Doctorat complet
Biologie Santé
Ile-de-France
Disciplines
Pharmacologie, Biologie Cellulaire, Biochimie
Laboratoire
STRUCTURE ET INSTABILITÉ DES GÉNOMES
Institution d'accueil
MUSEUM PARIS
Ecole doctorale
Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie - ED 227

Description

Les structures secondaires non usuelles des acides nucléiques (G-quadruplexes, R-loops,…) ont été décrites in vitro depuis plusieurs décennies et de nombreux travaux ont permis d’identifier leur importance cellulaire dans les mécanismes de régulation du métabolisme des acides nucléiques. Ces avancées ont été possibles grâce à la mise au point d’outils biomoléculaires (ligands spécifiques, anticorps,…) et à l’étude des protéines interagissant avec ces structures dans différents organismes modèles. Les structures G-quadruplexes, découvertes initialement aux télomères, sont essentielles dans le contrôle de l’activité transcriptionnelle des gènes et de l’épissage des ARN messagers, pour ne citer que quelques exemples. Les i-motifs, qui correspondent à des structures d’ADN à quatre-brins riches en cytosines dans lesquelles des cytosines sont intercalées grâce à des paires de bases C-C hémi-protonées, peuvent se former théoriquement au niveau des séquences génomiques complémentaires à celles des G-quadruplexes. Les i-motifs ont été principalement étudiés in vitro, en raison de leur formation à pH acide, mais des travaux récents montrent que la dépendance au pH n’est pas aussi stricte et que des i-motifs peuvent se former dans le noyau de cellules humaines. Contrairement aux G-quadruplexes, peu de molécules sont connues pour interagir de façon sélective avec l’i-motif in vitro et leurs effets intracellulaires sont mal connus.

le projet de thèse dans le domaine de la pharmacologie cellulaire et moléculaire porte sur la caractérisation et la compréhension des fonctions biologiques des i-motifs comparativement aux G-quadruplexes, en utilisant des ligands spécifiques capables de moduler la stabilité de ces structures et en étudiant les protéines interagissant avec les i-motifs par des techniques de pull-down dans le cadre du projet ANR iCARE.

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Compétences requises

Compétences en biologie cellulaire et moléculaire: culture cellulaire, cytométrie de flux, immunofluorescence...

Bibliographie

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Mots clés

G-quaduplexes, i-motifs, ligands de l'ADN, dommages de l'ADN, criblage moléculaire, protéome

Offre financée

Type de financement
ANR, Contrat Doctoral

Dates

Date limite de candidature 31/10/21

Durée36 mois

Date de démarrageDès que possible

Date de création30/08/21

Langues

Niveau de français requisC2 (maîtrise)

Niveau d'anglais requisB2 (intermédiaire)

Divers

Frais de scolarité annuels0 € / an

Site web

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