Description

Les régions marines périphériques jouent un rôle clé dans la genèse et le maintien de la biodiversité, en particulier en tant que centres d’endémisme. Toutefois, les processus évolutifs à l’origine de l’endémisme marin restent encore mal compris, notamment dans les archipels océaniques isolés. Dans un contexte de changements globaux rapides, une meilleure compréhension de ces mécanismes constitue un enjeu majeur, tant du point de vue fondamental que pour la conservation de la biodiversité marine.
L’archipel du Cap-Vert représente un système modèle exceptionnel pour étudier ces questions. Isolé du continent africain et des grandes provinces biogéographiques atlantiques, il abrite une faune marine riche et fortement endémique, malgré l’absence de récifs coralliens massifs. Les études existantes, limitées à quelques groupes taxonomiques, suggèrent des origines multiples et contrastées des lignées présentes, soulignant la nécessité d’une approche comparative et intégrative.
Ce projet de thèse vise à comprendre les mécanismes évolutifs responsables de la divergence génétique et de l’endémisme marin dans un archipel périphérique, en évaluant le rôle relatif de l’isolement géographique, de la dispersion à longue distance et de l’adaptation locale. Il s’appuie sur un important ensemble d’échantillons biologiques déjà acquis, issus de campagnes océanographiques récentes menées au Cap-Vert et dans d’autres régions atlantiques, couvrant une large diversité de groupes taxonomiques.
La thèse reposera sur une approche multitaxonomique combinant données génomiques (séquences mitochondriales, UCE, ddRADseq/SNPs), analyses phylogénétiques et phylogéographiques, génomique des populations et données morphologiques. Les résultats attendus permettront de caractériser la structuration génétique des populations du Cap-Vert, de reconstituer leur histoire évolutive et d’identifier d’éventuelles signatures d’adaptation locale. Ce travail contribuera à une meilleure compréhension des processus générateurs de biodiversité marine et du rôle des archipels périphériques dans l’innovation évolutive à l’échelle régionale et globale.

Compétences requises

Le/la candidat(e) devra avoir un Master en sciences de l’environnement, écologie, biologie marine ou disciplines connexes, avec une forte appétence pour la biodiversité et les systèmes naturels. Des compétences en génomique et analyses de données (bioinformatique, R/Python) sont souhaitées, mais une formation solide en écologie évolutive et en biologie des populations peut également constituer un bon profil. Le candidat doit être capable de conduire un travail pluridisciplinaire, de s’intégrer dans une équipe internationale, et de communiquer clairement ses résultats.

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Mots clés

Ecologie marine, Biodiversité marine, Génétique de la conservation, Phylogéographie, Dispersion larvaire, Génomique