Description

[FRANÇAIS] Cette thèse portera sur l’étude par spectroscopie RMN d'un court fragment d'une région désordonnée de la protéine non-structurale 5A (NS5A). La NS5A est essentielle à la réplication du virus de l'hépatite C (VHC), mais le mécanisme moléculaire sous-jacent reste difficile à cerner. L'étude de cette région protéique est compliquée par la présence de multiples résidus d'acides aminés proline. Ceux-ci présentent des conformations inhabituelles qui régulent les propriétés structurelles globales de la protéine, mais leur fonctionnement précis n'est pas bien compris. Nous proposons une stratégie originale impliquant des variants de proline fluorés non-naturelle afin de modifier leurs propriétés, ce qui permettra de dévoiler leur rôle dans la dynamique conformationnelle globale des peptides. À cette fin, nous avons déjà mis au point des multiples variants de prolines fluorées avec des propriétés spectrales uniques, ainsi que des moyens computationnelle et spectroscopiques pour les caractériser au sein des peptides. Nous utiliserons des méthodes RMN avancées pour extraire des informations spectrales qui renseignent sur la dynamique conformationnelle au sein de la NS5A. En particulier, la RMN 19F sera un puissant indicateur. L'objectif principal de ce projet sera d'établir une image structurelle des peptides NS5A, révélant comment les prolines régulent la réplication du VHC. Ce projet contribuera aussi à l'élaboration d'une nouvelle méthodologie RMN.

Compétences requises

[FRANÇAIS] Les candidats doivent avoir une formation en (bio)chimie ou en physique, avec une forte affinité pour la chimie analytique ou physique. Une formation ou un intérêt marqué pour la spectroscopie RMN et les sciences biomoléculaires est fortement recommandé. Une approche enthousiaste, proactive et coopérative est attendue, ainsi que la capacité à travailler de manière autonome et en équipe. Les activités quotidiennes consisteront principalement en des travaux de recherche, mais le candidat devra également participer à des séminaires internes, des cours, des événements scientifiques locaux et internationaux, ainsi qu'à la supervision d'étudiants en master ou en stage. La collaboration et l'interaction avec les autres chercheurs de l'équipe seront encouragées. Le candidat devra présenter ses travaux sous forme de rapports écrits et d'exposés oraux, ce qui nécessite de bonnes compétences en communication. La communication professionnelle avec le directeur de thèse et les autres membres de l'équipe se fera en anglais.

Bibliographie

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Mots clés

Spectroscopie RMN, Acides aminés fluorés, Protéines intrinsèquement désordonnées, Analyse conformationnelle, Virus de l'hépatite C, Développement de la méthodologie spectroscopique