Description

Le collagène de type I (COL1), principale armature structurale régissant les propriétés mécaniques des tissus chez les vertébrés, a pour bloc élémentaire une protéine hétérotrimèrique codée par deux gènes : col1a1 et col1a2. Sa néosynthèse tient une place centrale dans le métabolisme général, notamment pendant le développement, le vieillissement, mais aussi dans un ensemble de pathologies dégénératives, incluant le cancer, dont le point commun est la fibrose. Les mécanismes régulant la transcription de col1a1/col1a2 n’ont plus été étudié depuis des décennies. Entre temps, des concepts scientifiques et des outils technologiques ont révolutionné la biologie moléculaire. Considérant les premiers, et utilisant les seconds, nous comparerons les localisations sub-nucléaires des loci d’intérêt et identifierons les protéines constituant leur environnement immédiat au sein du noyau, en fonction de l’activité transcriptionnelle. Les méthodes reposent sur des outils moléculaires issus de la technologie Crispr/Cas9, la microscopie de fluorescence et la spectrométrie de masse. Nous pensons révéler de nouveaux acteurs clés de la (co-)régulation transcriptionnelle de col1a1 et col1a2, qui pourraient constituer des cibles thérapeutiques d’avenir.

Compétences requises

M2R en biologie, impliquant au minimum la biologie moléculaire ou la culture cellulaire et si possible une expérience de clonage moléculaire et/ou de biologie des ARNs. Idéalement, une expérience concrète en microscopie de fluorescence ou dans l'utilisation de systèmes CRISPR/Cas9 serait bienvenue. Parler anglais sera important pour interagir avec le co-encadrant. Il faudra pour le moins ne pas avoir peur de la bioinformatique.

Bibliographie

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Mots clés

facteur transcriptionnel, protéomique, C-BERST, remodelage chromatinien, fibrose