Description

Objectifs :
1. Évaluer la quantité et la qualité des ARN circulants humains et déterminer les applications possibles du profilage épitranscriptomique ;
2. Optimiser toutes les étapes de l'extraction des ARN, du traitement chimique et de la préparation des bibliothèques pour un séquençage fiable des ARN cibles ;
3. Mettre en place une technologie permettant un profilage épitranscriptomique robuste et précis des espèces d'ARN présentes dans les biopsies liquides humaines et les fluides corporels tels que le sang, la salive et l'urine ;
4. Appliquer la technologie développée au profilage de la cohorte de patients atteints de cancer de la prostate et les comparer avec des sujets sains ;
5. Explorer la possibilité d'associer cette analyse à la technologie de séquençage nanopore.

Résultats attendus :
1. Acquérir des connaissances sur la composition des ARN non codants stables dans les biopsies liquides humaines et les fluides corporels et sélectionner des cibles appropriées et pertinentes pour le profilage épitranscriptomique ;
2. Établir des profils de modifications de l'ARN de référence pour des sujets sains ;
3. Comparer les profils de modifications de l'ARN des sujets sains et des patients atteints de cancer de la prostate (PCa) ;
4. Évaluer l'adéquation des profils épitranscriptomiques de l'ARN comme biomarqueurs ONT du cancer de la prostate.

Compétences requises

Domaine de recherche : Sciences biologiques » Biologie Niveau d'éducation : Master ou équivalent Compétences/Qualifications • Solides connaissances générales en biochimie de l’ARN et biologie moléculaire • Connaissances de base des méthodes NGS (Illumina et ONT) et des protocoles de préparation de bibliothèques • Une certaine expérience en analyse de données dans l’environnement R ou Python serait bénéfique • Bonne expérience pratique en extraction et manipulation d’ARN Exigences spécifiques • Bonnes compétences en communication en anglais, à l’oral et à l’écrit • Solides compétences en organisation et rigueur scientifique • Curiosité et motivation pour des projets scientifiques • Personnalité orientée vers le travail en équipe Langues : ANGLAIS/FRANÇAIS Niveau : Bon Domaine de recherche : Sciences biologiques » Biologie

Bibliographie

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Mots clés

ARN, epitranscriptomique, sequencage, modification, biopsies liquides, cancer