Description

Le changement climatique, marqué par l’intensification des sécheresses, rend la réhabilitation durable des sites pollués par les méthodes de phytomanagement plus difficile. Les interactions entre déficit hydrique et contamination métallique, ainsi que leurs effets sur le microbiote tellurique, restent mal comprises, la plupart des études traitant ces stress séparément. Or, leur combinaison génère des effets délétères sur les espèces végétales et les communautés microbiennes rhizosphériques associées. En outre, les mécanismes impliqués dans ces effets demeurent encore mal connus. Ces incertitudes limitent le développement des phytotechnologies. Cette thèse vise à relever ce défi en développant des stratégies de phytomanagement adaptées à des multi- stress combinant à la fois la pollution (ex : éléments traces métalliques (ETM)) et déficit hydrique. Le sorgho, espèce résiliente, sera étudié en interaction avec des champignons mycorhiziens, connus pour améliorer le statut hydrique et la tolérance des plantes hôtes à la pollution métallique. Une approche multi-omiques permettra d’élucider les mécanismes régissant l’adaptation du continuum plante–microbiote et de sélectionner les génotypes les plus performants, tout en évaluant leur implication dans la restauration fonctionnelle des sols et le rétablissement de leurs services écosystémiques (stockage du carbone, fertilité, régulation de l’eau …).

Compétences requises

Le (la) candidat(e) devra avoir une formation en biologie végétale et en écologie microbienne avec un intérêt pour l'agroécologie. Des connaissances en biologie moléculaire, NGS (extraction et purification d’ADN/ARN, analyse bio-informatique de séquences) sont fortement recommandées, ou une forte motivation pour se former à ces méthodes. Des compétences en analyse statistique (idéalement avec R ou Python) seront fortement appréciées, ou à défaut des notions de bases et une volonté à les développer. Le ou la candidat (e) devra avoir un bon niveau en anglais à l'oral et à l'écrit pour communiquer ses résultats via différents moyens

Bibliographie

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Mots clés

sorgho, sols pollués, phytoremédiation, approches omiques, changement climatique, ETM