CF202647003
Processus évolutifs aux premiers stades de vie chez le chêne et le pin : le rôle de la diversité génétique
J-32
Doctorat Doctorat complet
Nouvelle-Aquitaine
Disciplines
Laboratoire
UMR 1202 BIOGECO - BIOdiversité, Gènes & Communautés
Institution d'accueil
Université de Bordeaux
Ecole doctorale
Sciences de l'environnement - ED 304

Description

Forest regeneration is a key evolutionary stage during which genetically diverse cohorts of seedlings experience strong mortality and selection driven by microenvironmental conditions and forest management. This PhD project aims to improve our understanding of how demographic and evolutionary processes, including genetic drift, natural selection, and parental contributions, shape genetic diversity and adaptive potential at early life stages in oak and pine. By combining genetic analyses of naturally regenerating forests under contrasted forest management and regeneration common garden experiments, the project will identify loci under microenvironmental selection and quantify the drivers of genetic diversity across successive seedling cohorts. A particular focus will be placed on the role of genetic mixtures (provenances within species) and assisted gene flow in enhancing forest resilience, productivity, and long-term adaptation. Results will be compared with range-wide patterns of genetic variation to assess their contribution to maintaining adaptive potential under climate change. The project will contribute to next-generation strategies for forest restoration and management, providing guidelines for the use of genetic mixtures and long-term experimental resources.

Compétences requises

Le candidat idéal pour ce doctorat devra avoir une formation en écologie, biologie évolutive ou génétique forestière, avec une expérience pratique du travail sur le terrain. Des compétences en génétique moléculaire, y compris l’extraction d’ADN, le génotypage et le séquençage, ainsi qu’une familiarité avec les analyses bioinformatiques et les approches de génomique des populations, sont souhaitables. Une expérience en conception expérimentale, en jardins communs ou expérimentations contrôlées, et en modélisation statistique est également pertinente. Le candidat doit être à l’aise avec la gestion de grands jeux de données, la réalisation d’analyses génétiques et l’intégration de données de terrain et génomiques. Des compétences organisationnelles solides, une autonomie dans la conduite de travaux sur plusieurs sites et la capacité à collaborer efficacement avec des équipes nationales et internationales sont essentielles. Un intérêt marqué pour la régénération forestière, la variation génétique adaptative et la conservation appliquée constituera un atout, de même qu’une bonne maîtrise de l’anglais, à l’écrit comme à l’oral.

Bibliographie

• Árnason E, Koskela J, Halldórsdóttir K, Eldon B. 2023. Sweepstakes reproductive success via pervasive and recurrent selective sweeps. eLife 12: e80781.
• Budde KB, Rellstab C, Heuertz M, Gugerli F, Hanika T, Verdú M, Pausas JG, González-Martínez SC. 2024. Divergent selection in a Mediterranean pine on local spatial scales. Journal of Ecology 112: 278-290.
• Haesen S, Lenoir J, Gril E, et al. 2023. Microclimate reveals the true thermal niche of forest plant species. Ecology Letters 26: 2043-2055.
• Pretzsch H. 2021. Genetic diversity reduces competition and increases tree growth on a Norway spruce (Picea abies [L.] Karst.) provenance mixing experiment. Forest Ecology and Management 497: 119498.
• Schmitt S, Tysklind N, Heuertz M, Hérault B. 2025. Selection in space and time: Individual tree growth is adapted to tropical forest gap dynamics. Molecular Ecology 34: e16392.
• Scotti I, Lalagüe H, Oddou‐Muratorio S, et al. 2023. Common microgeographical selection patterns revealed in four European conifers. Molecular Ecology 32: 393-411.
• Westergren M, Archambeau J, Bajc M, Damjanić R, Theraroz A, Kraigher H, Oddou-Muratorio S, González-Martínez SC. 2025. Low but significant evolutionary potential for growth, phenology and reproduction traits in European beech. Molecular Ecology 34: e17196.

Mots clés

Changement climatique, Adaptation génétique, Régénération forestière

Offre boursier / non financée

Ouvert à tous les pays

Dates

Date limite de candidature 27/05/26

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/26

Date de création25/03/26

Langues

Niveau de français requisC1 (autonome)

Niveau d'anglais requisC1 (autonome)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Contacts

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