Description

Les cassures de l'ADN représentent environ 75% des lésions et comportent souvent des « extrémités sales » (dépourvues de 5' phosphate ou 3' hydroxyle). Le traitement de ces extrémités est nécessaire pour restaurer l’intégrité de l’ADN, mais augmente les risques d’erreurs et d’instabilité génomique. Parmi ces cassures, celles à extrémité 5'OH sont fréquentes, mais leur rôle dans l'instabilité génomique reste mal compris. Pour combler cette lacune, j'ai développé une méthode de séquençage à l’échelle du génome permettant de cartographier ces extrémités et que j’ai appelée le 5'OH-seq. Cette technique ouvre un nouveau champ de recherche car elle permettra de comprendre comment ces cassures contribuent à l'instabilité génomique. Vu qu’une des sources de cassures 5’OH est lié à la formation de cassures médiées via la Topoisomerase 1 (Top1), ce projet de recherche via à mieux comprendre les régions que Top1 cible et sa potentielle implication dans la création d’instabilité génomique, bien que généralement considéré comme un gardien de la stabilité du génome. Ces connaissances sont cruciales pour mieux appréhender leur rôle dans des maladies comme le vieillissement, les maladies neurodégénératives et le cancer.

Compétences requises

Bonnes bases conceptuelle en biologie moléculaire - connaissance sur la réparation de l'ADN et les cassures dites 'sales'. De préférence (mais pas obligatoire): expériences en culture cellulaire (cellules humaines). Avoir effectué des stages dans différents laboratoire sera jugé comme un plus.

Bibliographie

pas applicable

Mots clés

Biologie moléculaire, Réparation ADN, Topoisomerase 1, méthode de séquençage à haut débit